Téléchargez vos données IRM

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Requis

Pour télécharger vos données il vous faut un compte sur les serveurs de l’UNF. Vous devez aussi connaitre le groupe auquel vous appartenez.

Vous avez deux façons différentes pour récupérer vos données IRM:

  • Utiliser un client SFTP (Windows, Mac, Linux)
  • Utiliser un terminal (Linux, Mac)

Utilisation d’un client SFTP

Installation

Filezilla est un logiciel que nous recommandons et qui est disponible sur tous les OS (Windows, Mac, Linux). Vous pouvez le télécharger en suivant le lien suivant Filezilla

Menu

Configuration - première utilisation

Démarrez Filezilla et ouvrez le menu File -> Site Manager Vous devriez obtenir la fenêtre suivante:

Configuration

Créez un nouveau site que vous pouvez nommer unf-dicom par exemple et remplissez les différents champs:

Host: elm.criugm.qc.ca

Protocol: SFTP-SSH File Transfer Protocol

Login Type: Ask for password

User: c’est le nom d’usager UNF qui vous a été créé lorsque vous avez fait votre demande de compte.

Ensuite cliquer sur le bouton Connect.

Vous pourriez voir apparaitre la fenêtre suivante:

Certificate

Cliquez sur Always trust et cliquez sur OK.

Finalement Filezilla vous demandera votre mot de passe UNF comme présenté dans la fenêtre suivante:

password

Vous êtes maintenant connecté sur les serveurs de l’UNF et vous devriez avoir une fenêtre semblable.

Main window

  • Rouge: votre système de fichier sur votre ordinateur.
  • Bleu: le système de fichier sur le serveur.
  • Vert: chemin utilisé sur le serveur

Vous pouvez déplacer des fichiers de droite à gauche ou inversement pour télécharger et/ou envoyer des données sur le serveur.

Utilisation du terminal (Mac, Linux, Windows usagers avancés)

Ouvrez un terminal et utilisez la commande ssh pour récupérer vos données IRM dans une archive tar.gz. Remplassez les champs unf_login et le chemin vers vos dicoms ainsi que le fichier tar.gz de destination

  • Télécharger un dossier et créer une archive tar.gz

ssh unf_login@elm.criugm.qc.ca tar czf - /path/vers/vos/dicom/ > fichier_destination_sur_votre_ordinateur.tar.gz

  • Télécharger une archive tar.gz

rsync -azv unf_login@elm.criugm.qc.ca:/unf/dicoms/by_groups_tar/chemin_vers_vos_dicoms dossier_destination_sur_votre_ordinateur

Accès à vos données IRM

Vos données IRM peuvent se trouver à 3 différents endroits. Remplacer groupName par votre groupe.

  • /unf/bids/groupName si vous avez demandé/coordonné une conversion BIDS automatique
  • /unf/dicoms/by_groups_tar/groupName si vos données sont relativement vieilles (avant 2016)
  • /unf/dicoms/by_groups/groupName si vos données ont été acquises plus récemment

Si vous souhaitez obtenir de l’aide pour télécharger vos données n’hésitez pas à envoyer un courriel à l’adresse suivante: support.unf.

Dernière modification 18.10.2020